В мире Linux широко используется пара программ diff и patch. diff создает файл, в который записываются различия между 2 файлами или 2 каталогами (т.н. патч), а patch позволяет "наложить" этот патч, т.е. имея патч и один из двух файлов (каталогов), получить другой. Основное применение этих программ - создание, распространение и применение патчей к исходным текстам программ.